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短程分子蒸餾的工作流程。

1、過濾。

汙水重力流進濾池，濾池中設有布水堰，通過引導從滾筒一端進入滾筒，再通過筒外表面上的長孔沿徑向流向多邊形過濾盤腔。

2、清洗。

過濾過程中，隨着固體懸浮物的不斷累積，部分汙泥吸附於濾布的內側，逐漸形成汙泥層，短程分子蒸餾的主機同時啟動，帶動過濾轉盤旋轉，對過濾盤上的濾板進行清洗。

3、排垢。

過濾板清洗過程中，泥水流入滾筒內的排泥槽裏，自動排出。

分子蒸餾在運行時其低壓額蒸餾理論上的分子蒸餾分離過程發生在0.01Pa值0.1Pa之間，在運行的過程中其蒸餾壓力可以增加化合物的分子運動平均自由程，進而擴大化合物間平均自由程的差異，達成分離。

分子蒸餾一般在傳統的蒸餾技藝多為釜式蒸餾，待分離的化合物先在沸點下氣化變成氣體，氣態的化合物在真空泵的作用下被整體抽出，流經冷凝器的時候才可以獲得冷凝。

冷凝器與蒸發面之間過長的距離，使得該段距離間充滿了氣態化合物，因而難減小蒸發液面處的壓力。對於分子蒸餾技藝，由於冷凝器與蒸發表面布置得緊密，待分離的化合物一旦揮發逸出，便被冷凝，因而冷凝器與蒸發器表面之間的氣態化合物分壓低，可以達成低壓下的化合物分離。